证书性质不同：初级会计师属于职称类证书，注册会计师就属于资格类证书；发展方向不同：注册会计师和初级会计师是属于两个不同的行业，初级会计师从事的是会计行业，注册会计师从事的是审计行业。
考试难度不同：
注会考试有专业阶段和综合阶段，需要先在连续5个考试年度内通过专业阶段6门考试科目后，再来报考综合阶段。
考试科目实行的是“6+1”模式，是指专业阶段考试6门考试科目包括会计、审计、财务成本管理、公司战略与风险管理、经济法、税法，综合阶段1门考试科目——“职业能力综合测试（试卷一、试卷二）。
初级会计职称的考试科目为初级会计实务和经济法基础，要求考生一次通过考试。
